O Controle Interno constitui unidade vinculada ao Gabinete do Prefeito e visa orientar a Administração Superior para a correta gestão dos recursos públicos no âmbito do órgão, preservando os interesses da Instituição e prevenindo a ocorrência de irregularidades, por intermédio do acompanhamento contábil, financeiro, orçamentário, operacional e patrimonial, consubstanciado na aplicação das técnicas de trabalho desenvolvidas no âmbito das boas práticas de gestão pública e de controle, sob os aspectos da legalidade, legitimidade, economicidade, eficiência e eficácia. É o responsável pela implantação de métodos e práticas operacionais a serem empregadas por todas as demais unidades que compõem a estrutura da Prefeitura, de forma a enfrentar os riscos e fornecer razoável segurança de que os objetivos e metas da instituição serão atingidos, observando-se os princípios da legalidade, legitimidade, eficácia, eficiência e economicidade. Entre outras, são competências do Controle Interno: Avaliar a gestão, visando comprovar a legalidade e a legitimidade dos atos, bem como, examinar os resultados quanto à economicidade, eficiência e eficácia da gestão orçamentária, financeira, patrimonial e demais sistemas administrativos e operacionais; Salvaguardar os ativos contra desvios, perdas e desperdícios, além de preservar os interesses da Prefeitura no que tange à prevenção de ilegalidade, erros, fraudes e outras práticas irregulares; Propor normatização, sistematização e padronização de procedimentos operacionais e administrativos a serem adotados no âmbito interno da Prefeitura; Acompanhar a implementação, pelas unidades da Prefeitura, das recomendações feitas pela Unidade de Controle Interno; Examinar os contratos, convênios, acordos, os processos de licitação, dispensa e inexigibilidade, o patrimônio, a fixação e a execução da despesa, a previsão e a arrecadação da receita, a observância dos limites legais e constitucionais entre outras solicitadas pelo Chefe do Executivo Municipal.

A Secretaria de Controle Interno (SCI) do município de Sena Madureira possui a seguinte estrutura funcional: Gabinete do Secretário(a) Gerente de Auditoria Interna

2019 Recomendação nº 002/2019 (23/01/2019) - Uso de veículos oficiais da municipalidade